截至2020年3月3日，全国医疗废物处理能力为5948.5吨/天，比起疫情前的4902.8吨/天，减少了1045.7吨/天。其中，湖北省能力从疫情前的180吨/天提升到了663.7吨/天，武汉市能力从疫情前的50吨/天提升到了261.7吨/天。自1月20日以来，全国总计处理医疗废物12.3万吨。3月3日当天，全国共计搜集医疗废物3135.7吨，其中定点医疗机构的牵涉疫情医疗废物570.4吨；当日全国集中于处理医疗废物3157.7吨（不含前日储存22.0吨），定点医疗机构的牵涉疫情医疗废物全部及时运输处理。
湖北省搜集401.0吨医疗废物当日全部处理。武汉市产生209.7吨医疗废物当日全部收运处理。累计到3月2日，武汉市前期积聚的192吨医疗废物已全部清运处理完。
全国31个省（自治区、直辖市）及新疆生产建设兵团现有定点医院2767家，接管定点医院污水的城镇污水处理厂2124座，集中于隔绝场所6259个。通过排查总计找到三大类343个问题，已全部排查已完成。
目前，全国医疗废水处理处理稳定有序，皆严苛实施消毒措施。环境监测结果表明，2020年1月20日至2月29日，337个地级以上城市空气自动监测结果表明，平均值优良天数比例为82.8%，优良天数比例比去年同期下降9.7个百分点。1799个国家水质自动车站预警监测数据表明，与去年同期相比，Ⅰ～Ⅲ类水质比例下降8.4个百分点，Ⅳ、Ⅴ类上升5.0个百分点，差Ⅴ类上升3.4个百分点。总计对11474个饮用水源地积极开展监测，并未找到不受疫情防控影响饮用水源地水质情况。
1562个饮用水源地积极开展了余氯监测，不受疫情防控积极开展的消杀工作等影响，47个饮用水源地余氯有检测，但浓度皆高于自来水厂入水标准（0.3 mg/L），其它饮用水源地余氯皆并未检测。湖北省对125个水源地积极开展监测，水质皆超过或高于Ⅲ类标准。
武汉市19个饮用水源地水质皆超过或高于Ⅲ类标准。
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